Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNBD1Q8NA66 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNBD1Q8NA66 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNBD1Q8NA66 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNBD1Q8NA66 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNBD1Q8NA66 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNBD1Q8NA66 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNBD1Q8NA66 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNBD1Q8NA66 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNBD1Q8NA66 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNBD1Q8NA66 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CNBD1Q8NA66 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNBD1Q8NA66 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNBD1Q8NA66 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNBD1Q8NA66 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNBD1Q8NA66 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms