Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AMER3Q8N944 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMER3Q8N944 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms