Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSGALNACT2Q8N6G5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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