Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 27
AGGF1Q8N302 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 26.9
AGGF1Q8N302 PLAG1-202ENST00000423799 1684 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.933e-6■■■■■ 26.9
AGGF1Q8N302 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.733e-6■■■■■ 26.9
AGGF1Q8N302 AC008537.1-201ENST00000601627 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.454e-12■■■■■ 26.9
AGGF1Q8N302 CDK5RAP1-208ENST00000471264 763 ntTSL 514.75□□□□□ -0.052e-9■■■■■ 26.9
AGGF1Q8N302 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.072e-9■■■■■ 26.9
AGGF1Q8N302 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.152e-9■■■■■ 26.9
AGGF1Q8N302 CDK5RAP1-205ENST00000460043 535 ntTSL 314.07□□□□□ -0.162e-9■■■■■ 26.9
AGGF1Q8N302 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.242e-9■■■■■ 26.9
AGGF1Q8N302 CDK5RAP1-215ENST00000496381 858 ntTSL 313.14□□□□□ -0.312e-9■■■■■ 26.9
AGGF1Q8N302 CDK5RAP1-210ENST00000473997 1930 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 26.9
AGGF1Q8N302 CDK5RAP1-216ENST00000498525 777 ntTSL 511.63□□□□□ -0.552e-9■■■■■ 26.9
AGGF1Q8N302 CDK5RAP1-204ENST00000427097 974 ntTSL 57.97□□□□□ -1.132e-9■■■■■ 26.9
AGGF1Q8N302 CDK5RAP1-213ENST00000482967 840 ntTSL 37.95□□□□□ -1.142e-9■■■■■ 26.9
AGGF1Q8N302 CDK5RAP1-212ENST00000481964 945 ntTSL 57.95□□□□□ -1.142e-9■■■■■ 26.9
AGGF1Q8N302 LCP2-210ENST00000628092 2421 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.727e-9■■■■■ 26.8
AGGF1Q8N302 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.27e-9■■■■■ 26.8
AGGF1Q8N302 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.287e-9■■■■■ 26.8
AGGF1Q8N302 PFKL-208ENST00000491298 819 ntTSL 513.48□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 26.8
AGGF1Q8N302 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.012e-12■■■■■ 26.8
AGGF1Q8N302 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.42e-12■■■■■ 26.8
AGGF1Q8N302 PIP5K1B-203ENST00000437200 791 ntTSL 56.03□□□□□ -1.442e-12■■■■■ 26.8
AGGF1Q8N302 PIP5K1B-204ENST00000440050 813 ntTSL 25.88□□□□□ -1.472e-12■■■■■ 26.8
AGGF1Q8N302 PIP5K1B-207ENST00000478500 3335 ntTSL 1 (best)5.28□□□□□ -1.562e-12■■■■■ 26.8
AGGF1Q8N302 ACSM3-203ENST00000501740 839 ntTSL 513.27□□□□□ -0.297e-8■■■■■ 26.8
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AGGF1Q8N302 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.634e-8■■■■■ 26.8
AGGF1Q8N302 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 38.63□□□□□ -1.033e-7■■■■■ 26.8
AGGF1Q8N302 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.442e-7■■■■□ 26.7
AGGF1Q8N302 TSNAX-DISC1-203ENST00000602885 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.07■□□□□ 0.162e-7■■■■□ 26.7
AGGF1Q8N302 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.082e-7■■■■□ 26.7
AGGF1Q8N302 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.24■□□□□ 0.032e-7■■■■□ 26.7
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AGGF1Q8N302 TSNAX-DISC1-205ENST00000602962 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.592e-7■■■■□ 26.7
AGGF1Q8N302 TSNAX-DISC1-201ENST00000602567 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.31□□□□□ -0.62e-7■■■■□ 26.7
AGGF1Q8N302 TSNAX-DISC1-202ENST00000602634 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.26□□□□□ -0.612e-7■■■■□ 26.7
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AGGF1Q8N302 LINC01980-203ENST00000455984 332 ntTSL 37.11□□□□□ -1.272e-7■■■■□ 26.7
AGGF1Q8N302 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.372e-7■■■■□ 26.7
AGGF1Q8N302 INMT-MINDY4-202ENST00000458257 2877 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.439e-7■■■■□ 26.7
AGGF1Q8N302 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.075e-10■■■■□ 26.7
AGGF1Q8N302 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.285e-10■■■■□ 26.7
AGGF1Q8N302 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 26.6
AGGF1Q8N302 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.393e-6■■■■□ 26.6
AGGF1Q8N302 KDM2A-201ENST00000308783 3666 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.713e-6■■■■□ 26.6
AGGF1Q8N302 KDM2A-208ENST00000527157 574 ntTSL 25.74□□□□□ -1.493e-6■■■■□ 26.6
AGGF1Q8N302 SNAP29-202ENST00000439214 681 ntTSL 37.5□□□□□ -1.212e-7■■■■□ 26.6
AGGF1Q8N302 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.221e-6■■■■□ 26.6
AGGF1Q8N302 LINC01310-201ENST00000380981 4015 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 26.5
AGGF1Q8N302 PLOD1-201ENST00000196061 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.451e-6■■■■□ 26.5
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AGGF1Q8N302 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.592e-6■■■■□ 26.5
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AGGF1Q8N302 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)15.34■□□□□ 0.053e-8■■■■□ 26.5
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AGGF1Q8N302 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.18e-7■■■■□ 26.4
AGGF1Q8N302 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.018e-7■■■■□ 26.4
AGGF1Q8N302 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.428e-7■■■■□ 26.4
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AGGF1Q8N302 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 26.4
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AGGF1Q8N302 CYP4F12-208ENST00000547332 593 ntTSL 49.14□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 26.4
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AGGF1Q8N302 ZNF326-201ENST00000340281 2729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.418e-7■■■■□ 26.4
AGGF1Q8N302 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.218e-7■■■■□ 26.4
AGGF1Q8N302 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.054e-16■■■■□ 26.3
AGGF1Q8N302 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.233e-7■■■■□ 26.2
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AGGF1Q8N302 FOXP4-AS1-204ENST00000440194 196 ntTSL 38.69□□□□□ -1.023e-7■■■■□ 26.2
AGGF1Q8N302 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.22e-7■■■■□ 26.2
AGGF1Q8N302 PHLDB1-214ENST00000528594 5787 ntTSL 215.85■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 26.2
AGGF1Q8N302 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.12e-7■■■■□ 26.2
AGGF1Q8N302 PHLDB1-218ENST00000530994 5945 ntTSL 215.53■□□□□ 0.082e-7■■■■□ 26.2
AGGF1Q8N302 PHLDB1-228ENST00000621027 1318 ntTSL 215.04■□□□□ -02e-7■■■■□ 26.2
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