Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVBPQ8N300 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms