Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00269Q8N2A0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms