Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A6

C4orf33, UPF0462 protein C4orf33, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf33Q8N1A6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf33Q8N1A6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf33Q8N1A6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms