Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VSIG10Q8N0Z9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VSIG10Q8N0Z9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms