Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS6Q8IU80 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms