Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TXNRD3Q86VQ6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNRD3Q86VQ6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms