Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6G3

NECAB2, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB2Q7Z6G3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECAB2Q7Z6G3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB2Q7Z6G3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECAB2Q7Z6G3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECAB2Q7Z6G3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECAB2Q7Z6G3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECAB2Q7Z6G3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECAB2Q7Z6G3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NECAB2Q7Z6G3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NECAB2Q7Z6G3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECAB2Q7Z6G3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECAB2Q7Z6G3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms