Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP1Q7Z6B7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRGAP1Q7Z6B7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP1Q7Z6B7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms