Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5N4

SDK1, Protein sidekick-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK1Q7Z5N4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDK1Q7Z5N4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SDK1Q7Z5N4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms