Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RD3Q7Z3Z2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RD3Q7Z3Z2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RD3Q7Z3Z2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms