Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA2D4Q7Z3S7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D4Q7Z3S7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms