Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP2Q7RTS6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTOP2Q7RTS6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP2Q7RTS6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms