Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMIM5Q71RC9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms