Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIAA1549LQ6ZVL6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIAA1549LQ6ZVL6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms