Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FGD6Q6ZV73 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FGD6Q6ZV73 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FGD6Q6ZV73 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms