Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
UBR3Q6ZT12 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBR3Q6ZT12 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
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