Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN12Q6ZSI9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN12Q6ZSI9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms