Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCARA5Q6ZMJ2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms