Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CEACAM20Q6UY09 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEACAM20Q6UY09 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms