Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VITQ6UXI7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VITQ6UXI7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms