Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCBE1Q6UXH8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCBE1Q6UXH8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms