Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VSTM1Q6UX27 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSTM1Q6UX27 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms