Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms