Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLPSL2Q6UWE3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms