Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A10Q6U841 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A10Q6U841 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A10Q6U841 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms