Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC137Q6PK04 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms