Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHBDF2Q6PJF5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDF2Q6PJF5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms