Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFWD3Q6PCD5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms