Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms