Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC41PQ6P2S7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC41PQ6P2S7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC41PQ6P2S7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms