Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EDC4Q6P2E9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
EDC4Q6P2E9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EDC4Q6P2E9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
EDC4Q6P2E9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
EDC4Q6P2E9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
EDC4Q6P2E9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
EDC4Q6P2E9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EDC4Q6P2E9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EDC4Q6P2E9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EDC4Q6P2E9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms