Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAVIN1Q6NZI2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms