Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD54Q6NXT1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms