Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NANOGP8Q6NSW7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms