Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
B4GALNT3Q6L9W6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
B4GALNT3Q6L9W6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms