Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT80Q6KB66 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT80Q6KB66 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms