Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LCN12Q6JVE5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms