Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFRP4Q6FHJ7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFRP4Q6FHJ7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms