Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO4Q6EEV6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms