Protein–RNA interactions for Protein: Q659A1

ICE2, Little elongation complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE2Q659A1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ICE2Q659A1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ICE2Q659A1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms