Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WSCD1Q658N2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WSCD1Q658N2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WSCD1Q658N2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WSCD1Q658N2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WSCD1Q658N2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
WSCD1Q658N2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WSCD1Q658N2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WSCD1Q658N2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WSCD1Q658N2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WSCD1Q658N2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
WSCD1Q658N2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
WSCD1Q658N2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
WSCD1Q658N2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WSCD1Q658N2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WSCD1Q658N2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms