Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF3Q5VWG9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF3Q5VWG9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms