Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOCADQ5VW36 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOCADQ5VW36 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOCADQ5VW36 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms