Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD1Q5VV17 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD1Q5VV17 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms