Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SFMBT2Q5VUG0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms