Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC39BQ5VTQ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC39BQ5VTQ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39BQ5VTQ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39BQ5VTQ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39BQ5VTQ0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39BQ5VTQ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39BQ5VTQ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39BQ5VTQ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC39BQ5VTQ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms